PrimeMate per Google Chrome

PrimeMate: Generatore di primer rapido e snello per Ensembl

PrimeMate è un add-on per Chrome sviluppato da PrimeMate che funge da generatore di primer per Ensembl. Consente agli utenti di generare centinaia di coppie di primer con parametri personalizzabili e di ordinarle in base alle loro preferenze.

Con PrimeMate, gli utenti possono lavorare facilmente con il database del genoma di Ensembl semplicemente navigando alla sequenza desiderata e cliccando su "trova primer". L'add-on offre una serie di opzioni personalizzabili come la lunghezza del prodotto ottimale, la temperatura di fusione, il contenuto di G/C e la soglia di dimerizzazione/struttura ad anello.

Una delle caratteristiche più interessanti di PrimeMate è la sua capacità di visualizzare informazioni dettagliate per ogni prodotto, inclusa la lunghezza, la temperatura di fusione e la posizione dell'esone. Gli utenti possono anche ordinare i risultati generati in base ai loro criteri preferiti regolando il peso di ordinamento per ogni variabile.

PrimeMate va oltre filtrando automaticamente i prodotti indesiderati, come i primer che formano dimeri o quelli con posizioni subottimali sulla sequenza. Offre anche l'opzione di salvare le sequenze selezionate dall'utente in una riga "Preferiti" per un facile accesso e consente la condivisione senza soluzione di continuità copiando le sequenze negli appunti.

In generale, PrimeMate è uno strumento potente ed efficiente per la generazione di primer in Ensembl, che offre un'interfaccia facile da usare e una vasta gamma di opzioni personalizzabili.